Protein–RNA interactions for Protein: P25106

ACKR3, Atypical chemokine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR3P25106 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR3P25106 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms