Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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