Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNOP22674 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNOP22674 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNOP22674 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNOP22674 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNOP22674 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNOP22674 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNOP22674 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNOP22674 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCNOP22674 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCNOP22674 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCNOP22674 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCNOP22674 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCNOP22674 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms