Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRHP20396 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRHP20396 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRHP20396 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRHP20396 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRHP20396 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRHP20396 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRHP20396 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRHP20396 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRHP20396 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
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