Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTRB1P17538 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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