Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRG2P13727 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG2P13727 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms