Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF35P13682 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms