Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD8P13378 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms