Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX6A1P12074 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms