Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VSIG8P0DPA2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms