Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms