Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD1P0DJD0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD1P0DJD0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD1P0DJD0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD1P0DJD0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD1P0DJD0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD1P0DJD0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD1P0DJD0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD1P0DJD0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD1P0DJD0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD1P0DJD0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD1P0DJD0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD1P0DJD0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms