Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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