Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTPBP07988 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms