Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA3O96018 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA3O96018 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA3O96018 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBA3O96018 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBA3O96018 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBA3O96018 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBA3O96018 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBA3O96018 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBA3O96018 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA3O96018 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA3O96018 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA3O96018 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA3O96018 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA3O96018 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA3O96018 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms