Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX7O95931 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBX7O95931 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBX7O95931 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CBX7O95931 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms