Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFT2D2O95562 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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