Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEC24AO95486 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SEC24AO95486 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SEC24AO95486 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SEC24AO95486 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SEC24AO95486 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SEC24AO95486 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SEC24AO95486 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24AO95486 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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