Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3O43889 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3O43889 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3O43889 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CREB3O43889 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms