Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF13O43567 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF13O43567 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF13O43567 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF13O43567 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF13O43567 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF13O43567 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF13O43567 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF13O43567 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF13O43567 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF13O43567 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms