Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
U2SURPO15042 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
U2SURPO15042 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms