Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms