Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms