Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms