Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM1B2RUZ4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM1B2RUZ4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms