Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB13A6NJU9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms