Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMX3A6NHT5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms