Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
C9orf92A6NGG3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms