Protein–RNA interactions for Protein: A6NFC5

TMEM235, Transmembrane protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM235A6NFC5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM235A6NFC5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM235A6NFC5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms