Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms