Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AUP1Q9Y679 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms