Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SNX13Q9Y5W8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SNX13Q9Y5W8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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