Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms