Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms