Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HPS5Q9UPZ3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HPS5Q9UPZ3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms