Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHANK2Q9UPX8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms