Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms