Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms