Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED23Q9ULK4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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