Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms