Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms