Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1Q9UJ41 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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