Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN11AQ9UI33 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms