Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms