Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRPC4Q9UBN4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPC4Q9UBN4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms