Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms