Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms