Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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