Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms