Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CMTM6Q9NX76 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms